第二次世界大战的结束彻底改变了这片群岛的命运，1945年2月的雅尔塔会议上，美英两国与苏联达成协议，在二战结束后，整个千岛群岛的主权都将划归苏联所有。1945年8月，苏联正式对日宣战，苏联红军迅速出兵占领了包括南千岛群岛在内的整个千岛群岛，随后苏联政府将岛上的日本居民全部遣返回日本本土，同时向岛上迁入了大量俄罗斯居民，主要是渔民和矿业工人，这片群岛从此正式成为苏联的领土，划归萨哈林州进行管辖。

二战结束之后，日本政府始终没有放弃对南千岛群岛的主权主张，声称这片群岛是日本的“固有领土”，并不在雅尔塔协议约定的划归苏联的千岛群岛范围内，俄日两国围绕这片群岛的争议从此正式开启。尽管苏联解体之后，俄罗斯继承了对这片群岛的实际管辖权，但两国始终未能就领土争议达成共识，至今都没有正式签署和平条约，南千岛群岛的归属问题，成为了横亘在俄日两国关系之间最大的障碍。[page]

三、难以替代的地缘战略价值

南千岛群岛的面积虽然不大，但其地缘战略价值在整个东北亚都极其突出。从地理位置上看，它正好扼守在鄂霍次克海通往太平洋的出口处，俄罗斯太平洋舰队从符拉迪沃斯托克出发，要进入太平洋公海，最便捷的通道就经过南千岛群岛之间的海峡。控制了南千岛群岛，俄罗斯的太平洋舰队就可以自由进出太平洋，直接突破第一岛链的封锁，获得面向太平洋的直接出海口，这对于俄罗斯的远东战略而言，是无可替代的核心利益。